BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

 0    171 Datenblatt    chomikmimi
mp3 downloaden Drucken spielen überprüfen
 
Frage język polski Antworten język polski
Białka, światło?
Lernen beginnen
Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza
Lernen beginnen
dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza
Lernen beginnen
dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'?
Lernen beginnen
Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm
Lernen beginnen
mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a?
Lernen beginnen
a260 = 20
RNA i ssDNA ile a?
Lernen beginnen
a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny?
Lernen beginnen
puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja?
Lernen beginnen
40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja?
Lernen beginnen
Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja?
Lernen beginnen
Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność
Lernen beginnen
Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność?
Lernen beginnen
Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność?
Lernen beginnen
zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid?
Lernen beginnen
plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla?
Lernen beginnen
Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla?
Lernen beginnen
Roślin
Biblioteki DNA
Lernen beginnen
zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne
Lernen beginnen
analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne
Lernen beginnen
są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane?
Lernen beginnen
w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty?
Lernen beginnen
Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna?
Lernen beginnen
ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I?
Lernen beginnen
ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa?
Lernen beginnen
ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to
Lernen beginnen
ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA
Lernen beginnen
Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza?
Lernen beginnen
trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A?
Lernen beginnen
ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H?
Lernen beginnen
ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi
Lernen beginnen
ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna
Lernen beginnen
Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA
Lernen beginnen
zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA
Lernen beginnen
zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne
Lernen beginnen
równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne?
Lernen beginnen
Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym?
Lernen beginnen
1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym?
Lernen beginnen
RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie?
Lernen beginnen
różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza
Lernen beginnen
od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie?
Lernen beginnen
od warunków
Napięcie w elektroforezie
Lernen beginnen
5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza?
Lernen beginnen
w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy?
Lernen beginnen
W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR?
Lernen beginnen
real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR?
Lernen beginnen
SYBR
cechy SYBR
Lernen beginnen
nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR?
Lernen beginnen
analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR?
Lernen beginnen
Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR?
Lernen beginnen
nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna
Lernen beginnen
z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna
Lernen beginnen
w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ)
Lernen beginnen
5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza
Lernen beginnen
0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza
Lernen beginnen
20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa
Lernen beginnen
alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary?
Lernen beginnen
Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia?
Lernen beginnen
autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia?
Lernen beginnen
Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia?
Lernen beginnen
Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii
Lernen beginnen
Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza
Lernen beginnen
gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy?
Lernen beginnen
zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest?
Lernen beginnen
cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
Lernen beginnen
autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa
Lernen beginnen
leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa
Lernen beginnen
wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1
Lernen beginnen
Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
Lernen beginnen
autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen
Lernen beginnen
11p13
jak dziedziczona alaktazemia?
Lernen beginnen
autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy?
Lernen beginnen
Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH?
Lernen beginnen
chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH?
Lernen beginnen
1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny
Lernen beginnen
prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny
Lernen beginnen
na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega
Lernen beginnen
Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie?
Lernen beginnen
Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen?
Lernen beginnen
gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom
Lernen beginnen
chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom
Lernen beginnen
Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm
Lernen beginnen
gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen
Lernen beginnen
gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen
Lernen beginnen
3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen
Lernen beginnen
12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria?
Lernen beginnen
autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie?
Lernen beginnen
Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie?
Lernen beginnen
barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa?
Lernen beginnen
w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa?
Lernen beginnen
w ph obojętnym
Co to sonikacja?
Lernen beginnen
Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja?
Lernen beginnen
Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad
Lernen beginnen
Puryny i pirymidyny
Puryny
Lernen beginnen
adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny
Lernen beginnen
cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna?
Lernen beginnen
Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy
Lernen beginnen
Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy?
Lernen beginnen
w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy?
Lernen beginnen
u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy?
Lernen beginnen
Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza
Lernen beginnen
Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy?
Lernen beginnen
CCC-DNA
co robi CCC-DNA?
Lernen beginnen
wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA?
Lernen beginnen
Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów
Lernen beginnen
od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy?
Lernen beginnen
U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy?
Lernen beginnen
u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy)
Lernen beginnen
30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy?
Lernen beginnen
Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy?
Lernen beginnen
odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr?
Lernen beginnen
Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT
Lernen beginnen
dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT
Lernen beginnen
osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT
Lernen beginnen
dla transferu białka
EASTERN BLOT
Lernen beginnen
dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym
Lernen beginnen
hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4)
Lernen beginnen
hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym
Lernen beginnen
denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA?
Lernen beginnen
ZAWSZE RNA
Multipleks PCR
Lernen beginnen
ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR
Lernen beginnen
wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR
Lernen beginnen
przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR
Lernen beginnen
Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz?
Lernen beginnen
200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda
Lernen beginnen
STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda
Lernen beginnen
STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda?
Lernen beginnen
STS-PCR
RACE-PCR
Lernen beginnen
szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS
Lernen beginnen
amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO
Lernen beginnen
połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO?
Lernen beginnen
sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA
Lernen beginnen
badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR
Lernen beginnen
wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR
Lernen beginnen
asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR
Lernen beginnen
odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ
Lernen beginnen
z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR
Lernen beginnen
losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr?
Lernen beginnen
mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter?
Lernen beginnen
w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot?
Lernen beginnen
w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR?
Lernen beginnen
Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami?
Lernen beginnen
RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych?
Lernen beginnen
FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA?
Lernen beginnen
nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH?
Lernen beginnen
Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish
Lernen beginnen
cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern?
Lernen beginnen
do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda
Lernen beginnen
Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda?
Lernen beginnen
hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern?
Lernen beginnen
Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda
Lernen beginnen
northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda
Lernen beginnen
southern
HGP
Lernen beginnen
projekt poznania ludzkiego genomu
knockout
Lernen beginnen
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza
Lernen beginnen
porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika
Lernen beginnen
wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika
Lernen beginnen
badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne?
Lernen beginnen
jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje?
Lernen beginnen
Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR
Lernen beginnen
niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star?
Lernen beginnen
kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki
Lernen beginnen
zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia
Lernen beginnen
odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne?
Lernen beginnen
Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają
Lernen beginnen
tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja
Lernen beginnen
lepkie konce
Restryktazy czworkowe
Lernen beginnen
rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe
Lernen beginnen
Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery
Lernen beginnen
enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy
Lernen beginnen
umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy
Lernen beginnen
odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

Sie müssen eingeloggt sein, um einen Kommentar zu schreiben.